More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23444 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_23444  predicted protein  100 
 
 		 676 aa  1370    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43212  predicted protein  54.4 
 
 		 602 aa  662    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 		 607 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 		 613 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 613 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 		 627 aa  605  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 605 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  48.47 
 
 		 614 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  48.46 
 
 		 606 aa  581  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  48.54 
 
 		 608 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 592 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 606 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 602 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  49.42 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 597 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 605 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  48.92 
 
 		 599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  48.42 
 
 		 609 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  48.09 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 596 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  48.14 
 
 		 616 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 596 aa  574  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1081  GTP-binding protein  48.09 
 
 		 622 aa  568  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00893132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  47.93 
 
 		 622 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 603 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  48.17 
 
 		 605 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  48.33 
 
 		 609 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  48.09 
 
 		 605 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 596 aa  568  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.93 
 
 		 596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  48.36 
 
 		 600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  48.17 
 
 		 598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  48.17 
 
 		 598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  49.26 
 
 		 600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  48.33 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  48.91 
 
 		 608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  47.83 
 
 		 606 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  48.42 
 
 		 603 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  48.41 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  48.26 
 
 		 603 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  48.26 
 
 		 603 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  47.67 
 
 		 605 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  48.05 
 
 		 613 aa  561  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  47.89 
 
 		 615 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  47.5 
 
 		 606 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  48.42 
 
 		 603 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  48.33 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  47.16 
 
 		 603 aa  558  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 608 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  47.88 
 
 		 613 aa  558  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0383  GTP-binding protein TypA  48.26 
 
 		 613 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  48.49 
 
 		 605 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  47.33 
 
 		 606 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  47 
 
 		 607 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  48.04 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  47.32 
 
 		 612 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1250  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 609 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0809475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  47.39 
 
 		 606 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  47.67 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 608 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  48.76 
 
 		 610 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  46.85 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  48.17 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  48.04 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  48.05 
 
 		 614 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  48 
 
 		 613 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  47.33 
 
 		 603 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  47.67 
 
 		 603 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  49.5 
 
 		 609 aa  558  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 608 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  46.75 
 
 		 609 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  47.6 
 
 		 602 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 608 aa  558  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 605 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  46.58 
 
 		 606 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 608 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  46.91 
 
 		 608 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  46.58 
 
 		 606 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  47.56 
 
 		 614 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  47.56 
 
 		 614 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  47.56 
 
 		 614 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  47.56 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  47.56 
 
 		 614 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  47.72 
 
 		 614 aa  555  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  49.08 
 
 		 616 aa  554  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  47.56 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  46.67 
 
 		 606 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.710155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>