More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_231 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  43.11 
 
 		 1096 aa  637    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  41.89 
 
 		 1023 aa  682    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  44.44 
 
 		 956 aa  783    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  51.72 
 
 		 1431 aa  974    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  40.23 
 
 		 1222 aa  655    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  100 
 
 		 970 aa  2011    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  40.38 
 
 		 1111 aa  630  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  39.01 
 
 		 860 aa  588  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  42.04 
 
 		 1566 aa  468  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  44.56 
 
 		 589 aa  465  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  44.06 
 
 		 522 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  41.49 
 
 		 1407 aa  459  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  42.91 
 
 		 1259 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  42.93 
 
 		 1558 aa  451  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  43.51 
 
 		 1519 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  39.94 
 
 		 995 aa  441  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 1414 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  37.35 
 
 		 1517 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  40.56 
 
 		 509 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  40.45 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  41.22 
 
 		 663 aa  369  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  40.35 
 
 		 495 aa  346  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  37.61 
 
 		 1443 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  40.64 
 
 		 1156 aa  343  8e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  35.82 
 
 		 1326 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  36.54 
 
 		 609 aa  292  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  34.81 
 
 		 1067 aa  288  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1108 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  33.21 
 
 		 648 aa  284  6.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 1112 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  34.96 
 
 		 773 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.72 
 
 		 1071 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  33.14 
 
 		 777 aa  281  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  32.88 
 
 		 1068 aa  280  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  34.61 
 
 		 939 aa  280  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  34.67 
 
 		 1107 aa  280  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.57 
 
 		 663 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  34.02 
 
 		 1077 aa  277  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  33.04 
 
 		 1093 aa  277  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  34.91 
 
 		 1068 aa  277  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1091 aa  277  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  33.2 
 
 		 1193 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1088 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.3 
 
 		 1091 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1088 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  34.13 
 
 		 1848 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  33.33 
 
 		 1134 aa  275  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 876 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.44 
 
 		 1901 aa  273  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.72 
 
 		 1178 aa  273  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1104 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 		 1068 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  30.63 
 
 		 1904 aa  271  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  33.47 
 
 		 1100 aa  271  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1105 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  33.78 
 
 		 711 aa  270  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 1069 aa  269  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  33.47 
 
 		 1069 aa  269  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  32.08 
 
 		 1354 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.8 
 
 		 1087 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.97 
 
 		 1080 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.82 
 
 		 666 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 1105 aa  267  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.3 
 
 		 914 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  33.27 
 
 		 896 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 1120 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.28 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.74 
 
 		 1086 aa  264  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  33.46 
 
 		 1082 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.73 
 
 		 1362 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32.7 
 
 		 1769 aa  263  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 1171 aa  263  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.11 
 
 		 1386 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  34.13 
 
 		 1070 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.22 
 
 		 1069 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  33.58 
 
 		 1082 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.52 
 
 		 1125 aa  260  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  31.08 
 
 		 1163 aa  260  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 		 1073 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  36.83 
 
 		 1765 aa  259  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 		 1073 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  33.58 
 
 		 1082 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 1082 aa  258  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.67 
 
 		 1072 aa  258  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 1073 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.4 
 
 		 1026 aa  257  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 1073 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  31.69 
 
 		 872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 		 1089 aa  256  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  32.88 
 
 		 1357 aa  256  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  31.6 
 
 		 1003 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 1155 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  31.76 
 
 		 918 aa  255  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 		 918 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  40.48 
 
 		 926 aa  254  6e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33 
 
 		 991 aa  254  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 		 918 aa  254  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 1139 aa  254  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  32.04 
 
 		 1150 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  31.76 
 
 		 918 aa  253  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>