177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22703 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_22703  predicted protein  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0386585  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  37.15 
 
 		 792 aa  170  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  36.52 
 
 		 1016 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  35.66 
 
 		 1297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  39.15 
 
 		 176 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  35.42 
 
 		 377 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  34.9 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  34.34 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  37.5 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  36.51 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  34.52 
 
 		 382 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  34.02 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  35.48 
 
 		 375 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  36.16 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  31.07 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  31.19 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45692  predicted protein  30.6 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.19 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  32.98 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  32.98 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  29.08 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  26.26 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  27.84 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  29.73 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  26.98 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  34.11 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  34.11 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  38.95 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  32.23 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  30.77 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  26.5 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  29.03 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  25.77 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  25.26 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  27.31 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  28.72 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  27.46 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  25.77 
 
 		 392 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  36.84 
 
 		 451 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  27.42 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  27.32 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  26.8 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  25.26 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  32.56 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  29.33 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  33.61 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  25.64 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  31.03 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  32.23 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  29.12 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  25.82 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  30.69 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  30.37 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  28.21 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  31.13 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  38.38 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  28.72 
 
 		 442 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  24.74 
 
 		 392 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  35.79 
 
 		 451 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  37.89 
 
 		 399 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  38.2 
 
 		 416 aa  52.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  34.17 
 
 		 382 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  24.87 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  32.08 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  32.71 
 
 		 394 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00420  ribonuclease D  31.97 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  31.54 
 
 		 389 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  24.87 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  33.06 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  33.06 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  33.06 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  35.48 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  30.56 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  40 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  34.69 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  29.82 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.41 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  33.33 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  32.32 
 
 		 437 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  37 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  35.71 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  36.27 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  25 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  31.93 
 
 		 447 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 449 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  29.63 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  30.93 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6686  Ribonuclease D  30.36 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  29.63 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  30.39 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  31.19 
 
 		 389 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  24.73 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  31.45 
 
 		 413 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  32.65 
 
 		 427 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  30.56 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  32.29 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.04 
 
 		 384 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 443 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.04 
 
 		 384 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>