163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22388 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  57.69 
 
 
189 aa  205  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  56.52 
 
 
189 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  57.92 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  59.12 
 
 
176 aa  198  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  55.56 
 
 
190 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  50.81 
 
 
179 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  53.59 
 
 
190 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  50 
 
 
175 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  53.04 
 
 
174 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  53.8 
 
 
175 aa  181  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.17 
 
 
175 aa  181  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  49.73 
 
 
179 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  50 
 
 
182 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  45.95 
 
 
181 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
182 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  51.37 
 
 
251 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  47.85 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  50 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  50 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  50 
 
 
245 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  49.73 
 
 
184 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  47.8 
 
 
246 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  50.54 
 
 
259 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  48.63 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  48.63 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  49.17 
 
 
247 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  48.66 
 
 
247 aa  164  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  50.82 
 
 
245 aa  164  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  52.72 
 
 
248 aa  164  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  48.35 
 
 
243 aa  164  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  48.35 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  49.73 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  48.35 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  48.35 
 
 
242 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  49.73 
 
 
248 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  48.66 
 
 
243 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  48.35 
 
 
243 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  48.35 
 
 
243 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  48.35 
 
 
243 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  50 
 
 
243 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  47.25 
 
 
242 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  47.83 
 
 
179 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  49.73 
 
 
238 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  50.54 
 
 
249 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  45.6 
 
 
242 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  47.8 
 
 
243 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  45.31 
 
 
242 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  45.95 
 
 
159 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  47.25 
 
 
249 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  47.57 
 
 
168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  46.95 
 
 
169 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  42.55 
 
 
167 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  44.32 
 
 
168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  40.76 
 
 
185 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  42.55 
 
 
167 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.39 
 
 
168 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  42.31 
 
 
160 aa  138  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  41.18 
 
 
214 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  44.62 
 
 
169 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  41.87 
 
 
190 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.39 
 
 
168 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.39 
 
 
168 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  41.87 
 
 
185 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  41.87 
 
 
214 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.15 
 
 
167 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  43.32 
 
 
168 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  41.87 
 
 
214 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  40.88 
 
 
161 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  43.32 
 
 
168 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  40.96 
 
 
166 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.81 
 
 
168 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.21 
 
 
168 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  43.01 
 
 
168 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  44.26 
 
 
168 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  42.71 
 
 
185 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.72 
 
 
183 aa  134  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  39.89 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  43.72 
 
 
168 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  42.47 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  42.47 
 
 
168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  42.47 
 
 
168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  43.96 
 
 
168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  41.08 
 
 
162 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.94 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  40.96 
 
 
166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  40.96 
 
 
166 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  40.22 
 
 
160 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  44.79 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  37.77 
 
 
166 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  39.13 
 
 
160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  40.22 
 
 
158 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  43.72 
 
 
168 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.57 
 
 
168 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
159 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  43.41 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.95 
 
 
157 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  42.7 
 
 
161 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  40.88 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.63 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>