More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22019 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_22019  predicted protein  100 
 
 
437 aa  901    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.89 
 
 
387 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  43.01 
 
 
393 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.8 
 
 
395 aa  279  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.94 
 
 
393 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.39 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.15 
 
 
393 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.79 
 
 
393 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.79 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
396 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.79 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.79 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.41 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.24 
 
 
393 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 
396 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.24 
 
 
414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.54 
 
 
393 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.36 
 
 
390 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  39.46 
 
 
431 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1333  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.4 
 
 
396 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  hitchhiker  0.00420458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.49 
 
 
393 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.75 
 
 
391 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.6 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.2 
 
 
395 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.9 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 
392 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.86 
 
 
390 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.04 
 
 
390 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.57 
 
 
395 aa  263  6e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  41.45 
 
 
407 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.57 
 
 
395 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 
393 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  39.75 
 
 
447 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  36.85 
 
 
417 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.56 
 
 
387 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.06 
 
 
394 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.75 
 
 
387 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.9 
 
 
410 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  39.5 
 
 
387 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.41 
 
 
387 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3842  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.11 
 
 
392 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.990363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.24 
 
 
393 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.36 
 
 
387 aa  260  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.47 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  39.25 
 
 
387 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  39.9 
 
 
393 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
390 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  38.58 
 
 
389 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.73 
 
 
393 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 
387 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.46 
 
 
390 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  38.32 
 
 
389 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
388 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 
387 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.73 
 
 
393 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 
387 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.1 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.31 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.4 
 
 
424 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  38.48 
 
 
389 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.5 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.31 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.79 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
389 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.46 
 
 
390 aa  253  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.79 
 
 
389 aa  252  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
389 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
387 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 
389 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
389 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.56 
 
 
390 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.05 
 
 
389 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 
393 aa  249  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.1 
 
 
390 aa  249  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.79 
 
 
389 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
390 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.31 
 
 
390 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1074  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.11 
 
 
387 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.490532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0966  acyl-CoA dehydrogenase  39.11 
 
 
387 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
389 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.25 
 
 
391 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.25 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.75 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
389 aa  243  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.27 
 
 
389 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001543  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.47 
 
 
335 aa  243  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.83 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.83 
 
 
385 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>