More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21929 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  100 
 
 		 1270 aa  2636    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  43.31 
 
 		 1205 aa  1018    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  40.82 
 
 		 1204 aa  890    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24382  predicted protein  48.48 
 
 		 1222 aa  1190    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00480  coatomer alpha subunit, putative  44.22 
 
 		 1222 aa  1030    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05972  Coatomer subunit beta', putative (Eurofung)  26.57 
 
 		 853 aa  248  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296123 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48514  predicted protein  24.76 
 
 		 931 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  25.71 
 
 		 962 aa  244  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  28.26 
 
 		 922 aa  214  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05570  ER to Golgi transport-related protein, putative  24.7 
 
 		 829 aa  214  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 1221 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 1193 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.79 
 
 		 1652 aa  139  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.44 
 
 		 1163 aa  138  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  31.07 
 
 		 742 aa  135  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.12 
 
 		 1363 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.59 
 
 		 947 aa  133  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.97 
 
 		 1831 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.28 
 
 		 317 aa  131  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.03 
 
 		 1236 aa  131  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 1557 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.61 
 
 		 1196 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28 
 
 		 1188 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1474 aa  128  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  34.8 
 
 		 1878 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.98 
 
 		 1247 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.66 
 
 		 676 aa  125  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.32 
 
 		 1364 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.3 
 
 		 1868 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.16 
 
 		 1760 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.41 
 
 		 1523 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1190 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 		 1213 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.53 
 
 		 576 aa  121  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.87 
 
 		 677 aa  121  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.79 
 
 		 1357 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.28 
 
 		 696 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.84 
 
 		 1454 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.31 
 
 		 1188 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.96 
 
 		 1443 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  31.87 
 
 		 790 aa  116  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 		 1711 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.57 
 
 		 335 aa  115  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.64 
 
 		 1398 aa  115  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 505 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  26.46 
 
 		 316 aa  114  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 577 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 1686 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.63 
 
 		 596 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.61 
 
 		 930 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 		 1240 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1367 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1789 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.47 
 
 		 1623 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.08 
 
 		 1267 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.54 
 
 		 434 aa  112  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.93 
 
 		 728 aa  112  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1807 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  27.8 
 
 		 316 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.18 
 
 		 1598 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.63 
 
 		 1547 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 		 316 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1553 aa  111  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 687 aa  109  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 		 443 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.58 
 
 		 1609 aa  108  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1858 aa  108  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 418 aa  108  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.63 
 
 		 316 aa  108  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  26.91 
 
 		 439 aa  108  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 		 316 aa  107  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.76 
 
 		 1411 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.92 
 
 		 1607 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 		 1208 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.83 
 
 		 1599 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.8 
 
 		 1626 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1552 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.57 
 
 		 924 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.55 
 
 		 1217 aa  105  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 335 aa  104  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.97 
 
 		 1583 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 740 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  27.97 
 
 		 612 aa  103  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.83 
 
 		 1416 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1214 aa  103  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  27.57 
 
 		 928 aa  102  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.22 
 
 		 1262 aa  102  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.42 
 
 		 1039 aa  101  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.09 
 
 		 919 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.42 
 
 		 1661 aa  101  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.14 
 
 		 1901 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 		 1481 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  26.8 
 
 		 518 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 630 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.33 
 
 		 1004 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.95 
 
 		 1617 aa  100  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1211 aa  99.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.98 
 
 		 682 aa  99.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.07 
 
 		 1348 aa  99.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.12 
 
 		 675 aa  99.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>