114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2171 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  100 
 
 
439 aa  890    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  45.89 
 
 
478 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  44.29 
 
 
471 aa  344  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  40.45 
 
 
442 aa  326  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  37.35 
 
 
526 aa  233  7.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  31.68 
 
 
494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  32.68 
 
 
438 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  33.42 
 
 
451 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  36.78 
 
 
441 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
458 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
434 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  37.4 
 
 
441 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  34.71 
 
 
433 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
434 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  34.78 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  36.36 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  34.78 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  34.78 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  36.36 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
436 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  33.94 
 
 
437 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  34.46 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
440 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
440 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  34.12 
 
 
441 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  36.16 
 
 
441 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  36.36 
 
 
441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  41.62 
 
 
216 aa  126  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  27 
 
 
497 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  24.2 
 
 
500 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  23.97 
 
 
489 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  25.61 
 
 
507 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  24.55 
 
 
488 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  24.55 
 
 
489 aa  96.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  24.6 
 
 
503 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  25 
 
 
493 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  23.97 
 
 
491 aa  90.1  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  25.64 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  24.51 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  22.67 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  23.09 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  23.99 
 
 
513 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  28.57 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  30.19 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  30.09 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  30.26 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  29.03 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  28.24 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  26.76 
 
 
501 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  28.71 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  27.1 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  26.48 
 
 
502 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  24.44 
 
 
525 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  25.57 
 
 
513 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  26.15 
 
 
504 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  22.97 
 
 
431 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  23.58 
 
 
912 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  24.42 
 
 
493 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  25.36 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  24.67 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  25.36 
 
 
431 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  24.8 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  23.56 
 
 
441 aa  53.5  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  24.1 
 
 
423 aa  53.5  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
444 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  24.18 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  24.18 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  24.46 
 
 
440 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  23.97 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  23.93 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  24.18 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  24.18 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  24.18 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  24.18 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  24.21 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  22.14 
 
 
895 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  24.79 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  24.35 
 
 
409 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  24.55 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  23.58 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  25.07 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  23.08 
 
 
411 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
474 aa  47  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  23.88 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  22.85 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  26.16 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  25.67 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  26.62 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>