More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21441 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21441  predicted protein  100 
 
 
416 aa  833    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389719  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2927  MFS family transporter: sugar  32.14 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38823  MFS family transporter: phosphate/sugar  28.34 
 
 
429 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726317  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  30.5 
 
 
506 aa  156  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  28.32 
 
 
440 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
449 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
449 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94272  MFS family transporter: phosphate  25.18 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0331064  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.24 
 
 
446 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  27.24 
 
 
424 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  28.72 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.49 
 
 
453 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.58 
 
 
449 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.49 
 
 
453 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.49 
 
 
453 aa  112  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.49 
 
 
453 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  23.26 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.26 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  23.32 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.26 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
442 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37881  MFS family transporter: phosphate/sugar  26.2 
 
 
487 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.441292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.87 
 
 
428 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.87 
 
 
428 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.87 
 
 
428 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.87 
 
 
428 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.87 
 
 
428 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  28.05 
 
 
466 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  26.26 
 
 
425 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  26.26 
 
 
425 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 
437 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.14 
 
 
448 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  28.04 
 
 
436 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  23.54 
 
 
427 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  26.91 
 
 
433 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  25.52 
 
 
436 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.44 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.3 
 
 
453 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.52 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.62 
 
 
429 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.27 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.52 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.52 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.14 
 
 
448 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.12 
 
 
436 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.56 
 
 
456 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
432 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
433 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  23.44 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  27.27 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.87 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.53 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.42 
 
 
440 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.42 
 
 
440 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.52 
 
 
435 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  28.12 
 
 
450 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.71 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  27.18 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  26.3 
 
 
426 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  26.18 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.33 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  27.36 
 
 
436 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  27.18 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  26.98 
 
 
444 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  26.35 
 
 
432 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  26.35 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  26.35 
 
 
432 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  27.18 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  26.35 
 
 
432 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.56 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
431 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  26.64 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  26.64 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.44 
 
 
445 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  23.56 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  23.1 
 
 
447 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  26.65 
 
 
447 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
451 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  26.65 
 
 
447 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  23.85 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  26.22 
 
 
435 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  25.71 
 
 
447 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.13 
 
 
428 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.19 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  22.22 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  25.62 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.19 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>