57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21354 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  100 
 
 		 422 aa  858    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  43.22 
 
 		 367 aa  266  7e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  42.6 
 
 		 480 aa  249  9e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  43.82 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  38.7 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  39.27 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  37.61 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  37.4 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  37.15 
 
 		 341 aa  216  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  38.31 
 
 		 362 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  37.4 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.33 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  39.12 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  36.72 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  40.43 
 
 		 367 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  37.64 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  37.86 
 
 		 364 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  40.12 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  37.32 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  36.89 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  36.47 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  36.49 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  35.95 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  35.21 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  38.73 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  38.42 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  34.74 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  37.43 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  37.39 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  35.96 
 
 		 343 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.72 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  35.23 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  37.06 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  37.06 
 
 		 358 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  31.91 
 
 		 350 aa  173  5e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  35.97 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  35.21 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.3 
 
 		 350 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  32.26 
 
 		 358 aa  163  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  33.84 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  34.95 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  34.45 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  30.73 
 
 		 367 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  29.78 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  29.64 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  34.4 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  28.33 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  24.08 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  24.08 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  23.17 
 
 		 363 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  22.58 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>