More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21316 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  55.89 
 
 
655 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  57.06 
 
 
645 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  55.51 
 
 
655 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 
655 aa  719    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  56.22 
 
 
655 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  56.31 
 
 
645 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  57.16 
 
 
641 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  56.17 
 
 
655 aa  735    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  55.87 
 
 
655 aa  723    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.46 
 
 
645 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  55.59 
 
 
655 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  55.84 
 
 
645 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  56.33 
 
 
655 aa  722    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  57.16 
 
 
641 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  56.01 
 
 
658 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  49.92 
 
 
636 aa  635    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  100 
 
 
727 aa  1496    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  56.04 
 
 
655 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  49.62 
 
 
636 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
628 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 
650 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  51.13 
 
 
662 aa  630  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  50.6 
 
 
642 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  49.32 
 
 
633 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
634 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.49 
 
 
633 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  48.18 
 
 
644 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  48.42 
 
 
640 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  48.67 
 
 
641 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  47.15 
 
 
644 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  48.35 
 
 
632 aa  609  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  48.11 
 
 
649 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  48.05 
 
 
644 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  48.12 
 
 
648 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
635 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  47.77 
 
 
643 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  48.5 
 
 
649 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  47.68 
 
 
643 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  46.03 
 
 
675 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  48.94 
 
 
633 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  47.73 
 
 
636 aa  601  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  46.56 
 
 
644 aa  602  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  49.02 
 
 
627 aa  599  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  48.17 
 
 
637 aa  600  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  47.87 
 
 
644 aa  597  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  48.09 
 
 
656 aa  598  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  49.24 
 
 
638 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  47.87 
 
 
643 aa  594  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  47.96 
 
 
637 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  46.54 
 
 
637 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  46.07 
 
 
652 aa  594  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  49.55 
 
 
640 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  47.84 
 
 
651 aa  593  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  48.49 
 
 
633 aa  591  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  46.75 
 
 
637 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  47.94 
 
 
641 aa  592  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  48.4 
 
 
645 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  47.43 
 
 
645 aa  589  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  45.8 
 
 
659 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  48.19 
 
 
640 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  46.3 
 
 
650 aa  587  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  46.91 
 
 
644 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  47.98 
 
 
648 aa  586  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  47.92 
 
 
645 aa  588  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  46.47 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  47.89 
 
 
640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  45.8 
 
 
665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  46.42 
 
 
644 aa  581  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  45.83 
 
 
635 aa  579  1e-164  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  47.13 
 
 
656 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  47.51 
 
 
635 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 
635 aa  581  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  46.77 
 
 
642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  48.66 
 
 
643 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 
657 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 
642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  49.4 
 
 
636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  48.19 
 
 
637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  46.17 
 
 
642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  48.34 
 
 
652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  46.14 
 
 
660 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  46.87 
 
 
634 aa  575  1.0000000000000001e-162  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  47.04 
 
 
651 aa  572  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  46.22 
 
 
654 aa  569  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  46.47 
 
 
642 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  45.55 
 
 
651 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  46.44 
 
 
650 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  46.94 
 
 
640 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  46.48 
 
 
638 aa  566  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  45.77 
 
 
658 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  44.64 
 
 
645 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  46.81 
 
 
642 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  44.49 
 
 
646 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  45.81 
 
 
686 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  48.21 
 
 
638 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  48.21 
 
 
638 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  47.34 
 
 
654 aa  568  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  48.76 
 
 
666 aa  568  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  47.35 
 
 
640 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.73 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>