67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21290 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  100 
 
 
385 aa  802    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59263  translation initiation factor eIF2b  32.37 
 
 
359 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  33.42 
 
 
433 aa  192  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  46.26 
 
 
453 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5458  predicted protein  33.61 
 
 
301 aa  133  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0354619  decreased coverage  0.00000724978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.73 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  31.07 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.88 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.79 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.43 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.67 
 
 
302 aa  86.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.22 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.54 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.93 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  24.8 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.52 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.05 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.77 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  26.85 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  29.5 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.82 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.24 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  27.69 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  28.35 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.83 
 
 
348 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  31.13 
 
 
310 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  24.9 
 
 
539 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  30.37 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  24.68 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.44 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  25 
 
 
505 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  29.24 
 
 
370 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  25.84 
 
 
489 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  24.66 
 
 
352 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33562  predicted protein  26.9 
 
 
505 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  31.5 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.48 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  30.46 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  26.53 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  22.7 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  24.62 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  24.35 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.14 
 
 
348 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.9 
 
 
366 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.36 
 
 
362 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28 
 
 
347 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.33 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.33 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.33 
 
 
347 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.14 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.7 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.33 
 
 
348 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.68 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  24.78 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  25 
 
 
283 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.67 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  24.26 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  24.66 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  24.41 
 
 
346 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  23.01 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  23.01 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  24.12 
 
 
351 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.38 
 
 
351 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  33.05 
 
 
348 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  26.06 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  25 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>