48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21228 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56016  predicted protein  33.95 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.047688 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10567  tRNA splicing 2' phosphotransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_2G02890)  28.83 
 
 
350 aa  92.8  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0307088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  29.61 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  30.85 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  30.89 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00310  tRNA 2'-phosphotransferase, putative  36.17 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0508161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.5 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  31.69 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  30.27 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  27.81 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.78 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.29 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.11 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  26 
 
 
186 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  27.94 
 
 
180 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.8 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  27.51 
 
 
185 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000161899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.58 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  28.22 
 
 
180 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  27.18 
 
 
182 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.72 
 
 
184 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.92 
 
 
194 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.26 
 
 
176 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  26.89 
 
 
194 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.72 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  28.72 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  28.72 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  28.87 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.72 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  28.72 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.57 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  28.18 
 
 
174 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  28.87 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  29.78 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  27.22 
 
 
182 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.63 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  25.27 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  29.26 
 
 
182 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  24.87 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  28.88 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  24.02 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  27.06 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  25.68 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  29.05 
 
 
394 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  0.0000000000000462587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>