More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20934 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20934  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
416 aa  845    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 
361 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 
361 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.36 
 
 
364 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  65 
 
 
362 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.98 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1505  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.13 
 
 
365 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0654454  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4403  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.55 
 
 
360 aa  458  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.71 
 
 
362 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29616  predicted protein  63.64 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.56 
 
 
357 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.68 
 
 
357 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.68 
 
 
357 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.28 
 
 
357 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.59 
 
 
357 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.54 
 
 
353 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.36 
 
 
351 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.15 
 
 
360 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.11 
 
 
350 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.94 
 
 
360 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.23 
 
 
358 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.26 
 
 
357 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.67 
 
 
360 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.72 
 
 
357 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.67 
 
 
360 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.04 
 
 
357 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.67 
 
 
360 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.1 
 
 
358 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.87 
 
 
357 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.92 
 
 
356 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.23 
 
 
357 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.15 
 
 
354 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.12 
 
 
360 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.42 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.4 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.55 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.84 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.32 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.42 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.51 
 
 
361 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.84 
 
 
360 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.54 
 
 
362 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1934  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 
367 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.39 
 
 
360 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.15 
 
 
358 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.21 
 
 
360 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.01 
 
 
360 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 
367 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.94 
 
 
358 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.55 
 
 
358 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.55 
 
 
358 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.29 
 
 
360 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.01 
 
 
360 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.24 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.15 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1571  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 
367 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07951  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0794  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.7 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.86487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  56 
 
 
371 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.46 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.74 
 
 
355 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
365 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
355 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 
355 aa  397  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.74 
 
 
355 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.74 
 
 
356 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 
359 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1643  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
355 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 
362 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
363 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2313  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3775  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.76 
 
 
358 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0674  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00238259  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.18 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3952  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.97 
 
 
356 aa  392  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.9 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 
357 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.34 
 
 
356 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.02 
 
 
356 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.75 
 
 
359 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2143  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.44 
 
 
356 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444097  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.06 
 
 
355 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
355 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.72 
 
 
362 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  55 
 
 
356 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 
355 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
362 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
362 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 
357 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>