39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20899 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20899  predicted protein  100 
 
 
496 aa  1017    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19586  predicted protein  29.34 
 
 
694 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44703  predicted protein  21.52 
 
 
1453 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.816493  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1527  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  26.97 
 
 
472 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35250  predicted protein  25.79 
 
 
527 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.45 
 
 
453 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  24.74 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44480  predicted protein  21.69 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000641793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  24.12 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  29.17 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  27.81 
 
 
685 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  27.32 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  23.62 
 
 
464 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
454 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  24.12 
 
 
464 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
464 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  27.01 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25 
 
 
391 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  26.28 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  26.28 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  29.3 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  26.28 
 
 
454 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  26.28 
 
 
454 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  26.28 
 
 
454 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
398 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>