More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20872 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.01 
 
 		 1396 aa  707    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  36.09 
 
 		 1535 aa  749    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  31.99 
 
 		 1667 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  36.74 
 
 		 1256 aa  783    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  31.28 
 
 		 1367 aa  648    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  32.94 
 
 		 1636 aa  676    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  34.31 
 
 		 1587 aa  738    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  33.89 
 
 		 1157 aa  661    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  100 
 
 		 1317 aa  2713    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  34.73 
 
 		 1549 aa  782    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  37.88 
 
 		 1135 aa  751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  37.9 
 
 		 1168 aa  750    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  33.05 
 
 		 1351 aa  612  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  38.99 
 
 		 1513 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.51 
 
 		 1549 aa  605  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  31 
 
 		 1640 aa  602  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  37.87 
 
 		 1423 aa  598  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  29.26 
 
 		 1381 aa  598  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.07 
 
 		 1507 aa  595  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  31.7 
 
 		 1573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  35.74 
 
 		 1458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  32.99 
 
 		 1248 aa  575  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  32.9 
 
 		 1127 aa  561  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.41 
 
 		 1669 aa  534  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.57 
 
 		 1514 aa  527  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.68 
 
 		 1623 aa  522  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  36.03 
 
 		 1416 aa  505  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.69 
 
 		 1659 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  33.47 
 
 		 1611 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.67 
 
 		 1705 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.5 
 
 		 1607 aa  440  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.86 
 
 		 1456 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  28.51 
 
 		 1557 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.86 
 
 		 1463 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.71 
 
 		 1115 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  27 
 
 		 1562 aa  361  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.32 
 
 		 1511 aa  355  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  25.78 
 
 		 1284 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.47 
 
 		 1773 aa  205  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.85 
 
 		 1179 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 620 aa  193  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 583 aa  191  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  25.14 
 
 		 1179 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48483  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  24.87 
 
 		 1250 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  27.99 
 
 		 578 aa  188  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.88 
 
 		 586 aa  188  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  29.62 
 
 		 592 aa  187  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  24.74 
 
 		 1218 aa  187  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  27.89 
 
 		 986 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  25.09 
 
 		 1218 aa  186  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.26 
 
 		 582 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  29.22 
 
 		 607 aa  184  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.65 
 
 		 639 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.65 
 
 		 603 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.32 
 
 		 573 aa  184  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.12 
 
 		 591 aa  184  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.41 
 
 		 641 aa  184  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.84 
 
 		 1013 aa  184  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  28.79 
 
 		 600 aa  184  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  29.08 
 
 		 764 aa  184  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  27.63 
 
 		 594 aa  183  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.38 
 
 		 627 aa  183  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.51 
 
 		 741 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.06 
 
 		 592 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.62 
 
 		 739 aa  182  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.32 
 
 		 971 aa  182  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  25.67 
 
 		 727 aa  182  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.39 
 
 		 1003 aa  181  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  26.88 
 
 		 610 aa  181  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  25.09 
 
 		 980 aa  181  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  26.87 
 
 		 599 aa  180  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.05 
 
 		 632 aa  181  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.58 
 
 		 738 aa  181  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 1000 aa  180  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.09 
 
 		 595 aa  179  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.07 
 
 		 594 aa  179  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  27.88 
 
 		 622 aa  179  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  27.07 
 
 		 627 aa  179  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  29.76 
 
 		 610 aa  179  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  27.95 
 
 		 598 aa  179  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  29.76 
 
 		 610 aa  179  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  26.81 
 
 		 634 aa  178  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  26.99 
 
 		 671 aa  178  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.25 
 
 		 607 aa  177  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.94 
 
 		 738 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  28.6 
 
 		 622 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.99 
 
 		 601 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  26.44 
 
 		 626 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  27.72 
 
 		 592 aa  177  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  30.61 
 
 		 596 aa  177  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  27.32 
 
 		 577 aa  177  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  28.11 
 
 		 619 aa  177  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  27.92 
 
 		 614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.88 
 
 		 597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.14 
 
 		 593 aa  177  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.88 
 
 		 597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  26.28 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  26.45 
 
 		 592 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.19 
 
 		 590 aa  176  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.46 
 
 		 628 aa  176  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>