211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20740 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  100 
 
 
837 aa  1724    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  31.75 
 
 
838 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  32.36 
 
 
819 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  38.65 
 
 
874 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  37.78 
 
 
769 aa  328  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  28.05 
 
 
724 aa  78.2  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  27.62 
 
 
245 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  26.8 
 
 
524 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  24.91 
 
 
1290 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  24.32 
 
 
441 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  30 
 
 
288 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01250  rRNA primary transcript binding protein, putative  27.17 
 
 
651 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  37.65 
 
 
89 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  25.14 
 
 
450 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
89 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
99 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  26.7 
 
 
194 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
125 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  40.86 
 
 
92 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  40.86 
 
 
92 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  43.06 
 
 
222 aa  58.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  25 
 
 
694 aa  57.8  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
137 aa  57.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  41.98 
 
 
117 aa  57.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
101 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  29.05 
 
 
477 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  22.5 
 
 
424 aa  57.4  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  20.86 
 
 
605 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  37.5 
 
 
128 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  37.5 
 
 
129 aa  56.6  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  37.36 
 
 
307 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  35.62 
 
 
552 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
146 aa  55.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  40.51 
 
 
134 aa  55.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.11 
 
 
245 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 
114 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 
94 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 
94 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  36.47 
 
 
128 aa  55.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
109 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 
162 aa  54.7  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 
250 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
207 aa  54.7  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  38.96 
 
 
107 aa  54.7  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.48 
 
 
116 aa  54.7  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 
250 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06850  RNA-binding protein rnp24, putative  26.38 
 
 
449 aa  54.3  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26255  predicted protein  36.11 
 
 
870 aa  54.7  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  28.82 
 
 
319 aa  54.7  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  41.18 
 
 
999 aa  54.3  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  24.19 
 
 
572 aa  54.3  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
615 aa  54.3  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
98 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
104 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  34.88 
 
 
99 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
87 aa  54.3  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  43.06 
 
 
90 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
88 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
101 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.14 
 
 
102 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 
90 aa  53.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
88 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
83 aa  52.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  21.43 
 
 
632 aa  52.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  36.59 
 
 
86 aa  52.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00330  cytoplasm protein, putative  31.68 
 
 
712 aa  52.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1930  RNA-binding region RNP-1  42.86 
 
 
89 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  42.11 
 
 
89 aa  52.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
88 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.15 
 
 
107 aa  52  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02310  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
444 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  32.63 
 
 
98 aa  52  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  32.95 
 
 
110 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
99 aa  52  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
90 aa  51.6  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  36.84 
 
 
85 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  34.15 
 
 
112 aa  52  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  39.24 
 
 
123 aa  52  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
132 aa  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  38.67 
 
 
222 aa  51.6  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
90 aa  51.6  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
111 aa  51.6  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
148 aa  51.6  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  44.16 
 
 
439 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  34.67 
 
 
328 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.97 
 
 
140 aa  51.2  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
150 aa  51.6  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
124 aa  51.2  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  23.31 
 
 
673 aa  51.2  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
85 aa  51.2  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  37.35 
 
 
87 aa  51.2  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_8132  predicted protein  40.58 
 
 
102 aa  51.2  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
103 aa  51.2  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
88 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
88 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1615  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 
85 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00287143  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  33.77 
 
 
182 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
102 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
95 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
152 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>