141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20716 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_20716  predicted protein  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  45.98 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9485  predicted protein  44.83 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0359849  normal  0.11207 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05100  RNA binding protein, putative  50.59 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  32 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  30.67 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  30.67 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.91 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 245 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  32.91 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  32 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  28 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  28 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  32.5 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  30.38 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 373 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  25.33 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  30.38 
 
 		 101 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.05 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  31.65 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  26.67 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  27.38 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  29.33 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  26.67 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  27.63 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  28 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  32.91 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  29.49 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  29.49 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  30.77 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  30.67 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  30.67 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  30.38 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  29.11 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  29.11 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  26.67 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  29.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2998  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  28.95 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  28.95 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  30.26 
 
 		 277 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30.14 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  22.83 
 
 		 477 aa  42.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  26.58 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03760  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1121 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  32.1 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  25.33 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  26.58 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 175 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  26.67 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  30.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>