More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20657 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  100 
 
 
369 aa  746    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.93 
 
 
314 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.49 
 
 
316 aa  358  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.16 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.65 
 
 
315 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  57.1 
 
 
315 aa  349  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.13 
 
 
314 aa  348  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.45 
 
 
314 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.45 
 
 
314 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  50.42 
 
 
365 aa  340  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.19 
 
 
316 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.19 
 
 
316 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.4 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.43 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.78 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.95 
 
 
316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.61 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.46 
 
 
317 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.13 
 
 
316 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.13 
 
 
316 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  38.83 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.18 
 
 
287 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
289 aa  208  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.78 
 
 
286 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.75 
 
 
283 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  37.22 
 
 
286 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.18 
 
 
287 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.18 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.81 
 
 
291 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
287 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
287 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.05 
 
 
295 aa  199  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  35.28 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 
282 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 
288 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
287 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.42 
 
 
290 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.22 
 
 
286 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.9 
 
 
286 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.22 
 
 
288 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  36.54 
 
 
288 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
291 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.02 
 
 
288 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  36.92 
 
 
345 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.7 
 
 
283 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.1 
 
 
290 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.9 
 
 
286 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  35.6 
 
 
286 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.3 
 
 
287 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.22 
 
 
286 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.22 
 
 
286 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
289 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.02 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.62 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  38.85 
 
 
295 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.46 
 
 
286 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.98 
 
 
291 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.01 
 
 
288 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  36.42 
 
 
294 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.95 
 
 
289 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.58 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.34 
 
 
288 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.01 
 
 
288 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.19 
 
 
289 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
286 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
298 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.78 
 
 
286 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.1 
 
 
287 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
288 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.3 
 
 
291 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.9 
 
 
286 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.9 
 
 
286 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.3 
 
 
291 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.9 
 
 
286 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.63 
 
 
293 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.9 
 
 
286 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.58 
 
 
287 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.28 
 
 
286 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.94 
 
 
288 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.94 
 
 
288 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.58 
 
 
286 aa  185  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.1 
 
 
287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>