13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20588 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  100 
 
 		 87 aa  177  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  54.84 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  50 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  45.9 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  42.37 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.24 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  42.86 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  35.29 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.89 
 
 		 76 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  32.56 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  36.23 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  36.84 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.73 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>