116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20574 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  49.25 
 
 		 818 aa  677    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  51.7 
 
 		 838 aa  741    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  51.79 
 
 		 781 aa  719    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  100 
 
 		 720 aa  1504    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  47.11 
 
 		 866 aa  634  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  33.17 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  32.52 
 
 		 551 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 		 549 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  33.5 
 
 		 602 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 		 558 aa  278  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  33.12 
 
 		 548 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  31.28 
 
 		 551 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.86 
 
 		 550 aa  274  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.53 
 
 		 550 aa  273  8.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.21 
 
 		 554 aa  273  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  31.61 
 
 		 559 aa  271  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 581 aa  270  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  31.96 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  31.34 
 
 		 545 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.31 
 
 		 558 aa  267  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 590 aa  267  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  32.31 
 
 		 549 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  32.31 
 
 		 549 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  32.31 
 
 		 549 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.34 
 
 		 548 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.24 
 
 		 555 aa  263  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  31.64 
 
 		 548 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  40.81 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.77 
 
 		 548 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  39.53 
 
 		 556 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  40.42 
 
 		 548 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  39.27 
 
 		 548 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  38.85 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  38.16 
 
 		 555 aa  246  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  38.85 
 
 		 549 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  38.85 
 
 		 542 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  39.63 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  36.21 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  38.22 
 
 		 550 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  31.51 
 
 		 564 aa  217  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 658 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  29.01 
 
 		 666 aa  158  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  26.86 
 
 		 649 aa  146  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  26.93 
 
 		 630 aa  144  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  27.12 
 
 		 551 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.95 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.15 
 
 		 451 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  28.05 
 
 		 491 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.12 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 494 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.42 
 
 		 590 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.51 
 
 		 509 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  26.51 
 
 		 509 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  28.88 
 
 		 479 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 444 aa  110  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25.78 
 
 		 517 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.07 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.9 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.09 
 
 		 488 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 449 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.83 
 
 		 654 aa  104  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.64 
 
 		 479 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.98 
 
 		 443 aa  101  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  28.54 
 
 		 468 aa  100  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.17 
 
 		 463 aa  97.8  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.13 
 
 		 440 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  24.57 
 
 		 451 aa  94.4  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 485 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 485 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  24.84 
 
 		 479 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  24.84 
 
 		 479 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  23.53 
 
 		 456 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  25.06 
 
 		 451 aa  89  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 		 479 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  24.57 
 
 		 451 aa  87.8  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.8 
 
 		 479 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  23.76 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  25.14 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  24.25 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  24.45 
 
 		 630 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.48 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25 
 
 		 951 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  21.98 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  27.12 
 
 		 581 aa  61.2  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  20.95 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.38 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  24.5 
 
 		 569 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  23.36 
 
 		 773 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  22.1 
 
 		 795 aa  52.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  27.84 
 
 		 707 aa  51.6  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  22.87 
 
 		 698 aa  51.2  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 629 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  23.1 
 
 		 799 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  23.55 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>