13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20120 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20120  predicted protein  100 
 
 
339 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22921  predicted protein  39.04 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.858448  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04830  conserved hypothetical protein  41.7 
 
 
801 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269217  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10676  UDP-galactose transporter (Eurofung)  34.36 
 
 
450 aa  175  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.552099 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_51835  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  34.18 
 
 
340 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230907  hitchhiker  0.00000272124 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33748  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  33.97 
 
 
323 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248456  hitchhiker  0.00153598 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46194  predicted protein  31.01 
 
 
399 aa  122  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.792848  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22739  predicted protein  33.54 
 
 
396 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30615  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50402  DMT family transporter: CMP-sialic acid/UDP-N-acetylglucosamine  27.47 
 
 
296 aa  86.7  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328391  normal  0.317384 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4234  predicted protein  29.63 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49849  predicted protein  25.74 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725945  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80295  putative UDP-galactose transporter  30.23 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525338  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29042  predicted protein  23.27 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>