23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20066 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20066  predicted protein  100 
 
 
347 aa  726    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  31.4 
 
 
272 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  28.93 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  29.11 
 
 
424 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7559  predicted protein  26.38 
 
 
227 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.41 
 
 
812 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  29.39 
 
 
1202 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  26.72 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13119  predicted protein  29.76 
 
 
241 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128746  normal  0.100264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  28.78 
 
 
619 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  25.47 
 
 
666 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39605  predicted protein  21.29 
 
 
316 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673199  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43432  predicted protein  26.53 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00267457  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0638  hypothetical protein  30.99 
 
 
884 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.102075  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4936  predicted protein  24.5 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9664  predicted protein  23.23 
 
 
259 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.345289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  28.21 
 
 
1096 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  29.44 
 
 
1066 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  24.03 
 
 
475 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4741  predicted protein  22.13 
 
 
237 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16088  predicted protein  22.83 
 
 
478 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00877055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  25.6 
 
 
725 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16085  predicted protein  28.57 
 
 
550 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659128  hitchhiker  0.00285712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>