29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20034 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  100 
 
 
306 aa  633    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  37.12 
 
 
351 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  36.88 
 
 
360 aa  209  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  37.29 
 
 
256 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  35.45 
 
 
349 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  34.92 
 
 
276 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  31.86 
 
 
274 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  32.09 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  34.16 
 
 
221 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  32.99 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  32.99 
 
 
270 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  32.51 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  31.63 
 
 
252 aa  92.8  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  33 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  29.7 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  27.03 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  30.65 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  24.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  26.83 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  28.37 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  26.92 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  25.96 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  24.23 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  27.92 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  26.44 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  20.92 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  27 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  22.81 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  21.85 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>