10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19932 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_19932  predicted protein  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27950  predicted protein  28.09 
 
 
271 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45972  predicted protein  24.39 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.587213  normal  0.488793 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02560  syntaxin, putative  27.44 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34593  predicted protein  26.97 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0614631 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  36.36 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  24.71 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  25.29 
 
 
260 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  26.51 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.336324 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  32.05 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>