80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1971 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  100 
 
 		 492 aa  1026    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  32.46 
 
 		 495 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  32.06 
 
 		 789 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  30.49 
 
 		 844 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  32.4 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  30.28 
 
 		 871 aa  202  8e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  29.08 
 
 		 749 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  29.03 
 
 		 482 aa  196  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  27.72 
 
 		 690 aa  189  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  28.91 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  27.92 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  30.1 
 
 		 617 aa  173  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  32.06 
 
 		 918 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  30.71 
 
 		 892 aa  143  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  32.8 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  53.19 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  37.89 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  50.98 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  50.98 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  34.48 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  50 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  52.08 
 
 		 302 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1026  patatin family phospholipase  44.29 
 
 		 171 aa  50.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  47.06 
 
 		 345 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  30.36 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  30.36 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  47.06 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  47.06 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.97 
 
 		 763 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.21 
 
 		 748 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  24.91 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  37.04 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  45.1 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  45.1 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  45.1 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  35 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  36.36 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  47.83 
 
 		 334 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  46.43 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  47.92 
 
 		 311 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  41.51 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 		 765 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  34.85 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  44.9 
 
 		 311 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  43.64 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  43.4 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  44.44 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  43.75 
 
 		 760 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  44.44 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  47.17 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  47.92 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  41.51 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  45.65 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  41.67 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  24.87 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  46.81 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  51.16 
 
 		 308 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  47.92 
 
 		 317 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2849  phospholipase, patatin family  45.1 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.41074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  45.1 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  36.84 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  43.1 
 
 		 720 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  47.92 
 
 		 358 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  43.48 
 
 		 256 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  46.81 
 
 		 735 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  44.68 
 
 		 277 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  41.18 
 
 		 293 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  35.06 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  35 
 
 		 345 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.71 
 
 		 318 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  44.68 
 
 		 751 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  41.82 
 
 		 412 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  41.82 
 
 		 412 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  41.38 
 
 		 417 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  41.51 
 
 		 263 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  41.51 
 
 		 263 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  41.51 
 
 		 263 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  44.68 
 
 		 740 aa  43.5  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  45.65 
 
 		 796 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>