More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19708 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01581  fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I  62.21 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.733068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03993  anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B)  60.27 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2031  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.21 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0136036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3870  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  60.27 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1875  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.82 
 
 
548 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.27379  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1417  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.95 
 
 
548 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.70407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3124  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.59 
 
 
564 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00427914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4676  fumarate hydratase  60.27 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2322  fumarate hydratase  62.21 
 
 
548 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387044  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5566  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.44 
 
 
548 aa  698    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.63 
 
 
548 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0961  fumarate hydratase, class I  65.83 
 
 
539 aa  708    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.426877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.63 
 
 
548 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5483  fumarase  62.48 
 
 
551 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0951  fumarate hydratase, class I  65.64 
 
 
581 aa  708    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3258  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.33 
 
 
547 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000853495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1577  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.82 
 
 
548 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.551964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4675  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.2 
 
 
555 aa  683    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.63947  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01571  hypothetical protein  62.21 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2560  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.67 
 
 
549 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0557449  normal  0.126998 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03954  hypothetical protein  60.27 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1023  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.02 
 
 
547 aa  677    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1636  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.82 
 
 
548 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3271  fumarate hydratase, class I  62.21 
 
 
547 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4397  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  65.18 
 
 
551 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.617771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4588  fumarate hydratase class I, anaerobic  60.08 
 
 
548 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1337  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  64.75 
 
 
548 aa  703    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2206  fumarase  65.84 
 
 
548 aa  716    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3404  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.21 
 
 
547 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3762  fumarate hydratase, class I  63.77 
 
 
555 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86934  predicted protein  67.41 
 
 
560 aa  759    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2018  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.33 
 
 
535 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0713  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.81 
 
 
550 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0340597  normal  0.16476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1533  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.69 
 
 
551 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5636  fumarate hydratase  59.85 
 
 
548 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1492  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.83 
 
 
554 aa  718    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1820  fumarate hydratase  62.21 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1831  fumarase  61.63 
 
 
548 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.640602  hitchhiker  0.002407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1708  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  64.06 
 
 
551 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0933  fumarate hydratase, class I  62.4 
 
 
547 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.140694  normal  0.173179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0786  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.63 
 
 
547 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4695  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.63 
 
 
548 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1149  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  60.76 
 
 
554 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.691464  normal  0.943485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0881  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.04 
 
 
534 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1687  fumarate hydratase  62.21 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.713112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1567  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.82 
 
 
548 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3905  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  60.08 
 
 
548 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3285  fumarase  59.22 
 
 
534 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6383  hydro-lyase Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, subunit beta  65.27 
 
 
547 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8500  fumarate hydratase, class I  62.79 
 
 
550 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4245  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.39 
 
 
568 aa  688    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201953  normal  0.0592114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4555  fumarate hydratase class I, anaerobic  61.43 
 
 
548 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2916  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  65.24 
 
 
538 aa  712    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36455 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1798  fumarate hydratase  62.21 
 
 
548 aa  679    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.773214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2336  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  60.15 
 
 
538 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.801629  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3238  fumarase  63.34 
 
 
535 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2018  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.21 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1061  fumarase  61.7 
 
 
571 aa  681    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1706  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.02 
 
 
548 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.142614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24490  fumarase  64.02 
 
 
567 aa  708    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208028  normal  0.69636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4564  fumarate hydratase  61.43 
 
 
548 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4363  fumarate hydratase  60.27 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1587  fumarate hydratase  62.02 
 
 
548 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.596697  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3082  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily subunit beta  65.08 
 
 
551 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0162  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  66.4 
 
 
538 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19708  precursor of fumarase fumarase  100 
 
 
567 aa  1176    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0631  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.42 
 
 
547 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2144  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.66 
 
 
548 aa  656    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  0.384871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2225  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  65.96 
 
 
539 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4022  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.6 
 
 
548 aa  677    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00935684  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1080  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  66.73 
 
 
546 aa  745    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2076  fumarate hydratase protein class I  64.33 
 
 
534 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3184  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.82 
 
 
549 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.493682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2239  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.64 
 
 
535 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.747448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0889  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.69 
 
 
541 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000151157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0749  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.01 
 
 
541 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000017058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3371  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.69 
 
 
541 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1809  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  58.8 
 
 
540 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1888  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  58.8 
 
 
540 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1651  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  58 
 
 
541 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000020704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2570  fumarase  59.27 
 
 
541 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013592  normal  0.472366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2068  fumarase  58.41 
 
 
540 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3051  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  56.61 
 
 
540 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708755  normal  0.340068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0745  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  55.13 
 
 
550 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0994  fumarate hydratase, class I  56.17 
 
 
541 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0825  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate family  54.16 
 
 
550 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0693  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  55.36 
 
 
538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.635421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2615  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  56.74 
 
 
542 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000086832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1977  fumarate hydratase  29.26 
 
 
512 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.146696  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1413  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  31.97 
 
 
507 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515679  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2232  fumarase  30.84 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3136  fumarase  32.19 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119324  normal  0.0284437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1941  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  31.97 
 
 
507 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757012  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2222  fumarate hydratase, class I, anaerobic, putative  29.64 
 
 
516 aa  181  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2200  fumarase  29.45 
 
 
514 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000257918  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2124  fumarase  29.45 
 
 
514 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2302  fumarase  29.45 
 
 
514 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00101336  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0348  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  31.07 
 
 
502 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2102  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  31.03 
 
 
507 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228521  normal  0.564936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2273  fumarase  32.4 
 
 
521 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0060992  hitchhiker  0.00178376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>