More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19659 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  100 
 
 
465 aa  954    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  50.91 
 
 
494 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01850  alcohol dehydrogenase, putative  50.59 
 
 
519 aa  385  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0520343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
428 aa  335  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
435 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
433 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 
422 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.11 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0239649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  40.66 
 
 
425 aa  313  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.63 
 
 
428 aa  312  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
428 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
418 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
427 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.91 
 
 
429 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
410 aa  220  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
437 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
398 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
395 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.73 
 
 
400 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.73 
 
 
400 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
400 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
392 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
400 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.44 
 
 
384 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.66 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.82 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
395 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.16 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  30.77 
 
 
387 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
379 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
387 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.88 
 
 
400 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
388 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
385 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.08 
 
 
386 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
382 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
384 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
386 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.33 
 
 
386 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
387 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
388 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
387 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 
389 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.08 
 
 
388 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
406 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
387 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
390 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 
399 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  31.87 
 
 
394 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
387 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0145  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 
384 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 
418 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
387 aa  141  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
388 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1709  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 
867 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  28.81 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 
383 aa  140  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
382 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.13 
 
 
382 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.51 
 
 
388 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 
391 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 
389 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
384 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
387 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  25.54 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  28.9 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.11 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.28 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
382 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
386 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  26.28 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
408 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 
397 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 
388 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.4 
 
 
637 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 
405 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  28.29 
 
 
388 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>