97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19438 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  100 
 
 		 529 aa  1102    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  37.41 
 
 		 650 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  37.32 
 
 		 653 aa  297  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  41.9 
 
 		 378 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  47.24 
 
 		 743 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  28.97 
 
 		 611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  27.17 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  25.65 
 
 		 597 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  22.32 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  22.7 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  23.16 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 		 669 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  28.92 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  21.89 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  28.24 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  28.65 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  23.36 
 
 		 282 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  28.65 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  25.28 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  23.61 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  23.61 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  21.78 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  22.39 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  27.62 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  28.09 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  23.33 
 
 		 279 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  24.89 
 
 		 287 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  21.79 
 
 		 291 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  25.31 
 
 		 285 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  34.62 
 
 		 259 aa  54.7  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  22.82 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  34.62 
 
 		 261 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  27.93 
 
 		 262 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  27.93 
 
 		 262 aa  54.3  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  32.05 
 
 		 268 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  24.72 
 
 		 283 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  22.85 
 
 		 283 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  34.62 
 
 		 256 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  23.26 
 
 		 327 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  22.98 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  29.38 
 
 		 270 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  26.85 
 
 		 307 aa  51.2  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  22.55 
 
 		 266 aa  50.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  25.84 
 
 		 374 aa  50.4  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  28.57 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  24.63 
 
 		 278 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  23.58 
 
 		 312 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  23.32 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  27.53 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  23.85 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  39.13 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  27.14 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  29.14 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  23.85 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  24.71 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  25.22 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.82 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  25 
 
 		 260 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  25.73 
 
 		 292 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  38.03 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  22.32 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  27.98 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  34.78 
 
 		 282 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.34 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  40 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  33.82 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  24.4 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  33.82 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  25.99 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  24.27 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.66 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  22.49 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  35.44 
 
 		 314 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  23.19 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  29.36 
 
 		 314 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  35.71 
 
 		 323 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  39.39 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  26.26 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  33.82 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  23.91 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  20.24 
 
 		 281 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  25.34 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  21.52 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  23.93 
 
 		 310 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  27.17 
 
 		 293 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  35.14 
 
 		 458 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  22.27 
 
 		 258 aa  44.3  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  21.49 
 
 		 498 aa  44.3  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.26 
 
 		 438 aa  44.3  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.88 
 
 		 285 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  23.21 
 
 		 281 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2391  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.9 
 
 		 192 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  23.56 
 
 		 313 aa  43.9  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  36.76 
 
 		 437 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  22.79 
 
 		 369 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  32.43 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>