94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19341 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  40.84 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27881  predicted protein  39.57 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115527 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  37.7 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  34.67 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  25.13 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  26.06 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.08 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  23.16 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.08 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25.52 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  22.87 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  24.46 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  23.93 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  24.54 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11795  predicted protein  43.33 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.937655  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  23.73 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.73 
 
 		 304 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  23.37 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  23.31 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25.27 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  23.91 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  23.98 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  27.88 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.6 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  25.44 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  24.51 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  23.37 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  23.79 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  26.04 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  22.99 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  26.04 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  23.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  23.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  23.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  23.71 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  26.2 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  24.36 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  22.45 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  24.28 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  27.01 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.75 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.54 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  20.31 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  21.74 
 
 		 282 aa  52  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  23.4 
 
 		 297 aa  51.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  22.34 
 
 		 246 aa  51.2  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  20.1 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  24.85 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  23.21 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  21.47 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  22.35 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  22.7 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  22.75 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  23.35 
 
 		 276 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  21.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  23.35 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  20.86 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  20.81 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  22.42 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  21.74 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  25 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89662  B-type subunit of proteasome  22.6 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.596472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  24.57 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  23.98 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  20.96 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  24.52 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  20.3 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  25.99 
 
 		 257 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  23.64 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  27.91 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  23.6 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  22.81 
 
 		 278 aa  44.7  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  24.43 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  20.21 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  21.71 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  22.15 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  22.09 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  23.3 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  22.34 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  22.22 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  23.5 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  25 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  23.63 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  25.84 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  19.07 
 
 		 280 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  19.88 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  20.96 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  25.26 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  25.57 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  25.47 
 
 		 245 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  19.65 
 
 		 279 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  21.69 
 
 		 273 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>