More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18217 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18217  predicted protein  100 
 
 
326 aa  673    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00902772  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01830  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  31.65 
 
 
323 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29215  predicted protein  32.39 
 
 
317 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.52 
 
 
1523 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.24 
 
 
1557 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
1240 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.33 
 
 
947 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25 
 
 
1454 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.51 
 
 
1868 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 
1163 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.58 
 
 
930 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.09 
 
 
1364 aa  96.3  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
682 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.2 
 
 
1280 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  27.24 
 
 
359 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.6 
 
 
505 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.41 
 
 
1363 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.73 
 
 
1196 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.27 
 
 
733 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.24 
 
 
1856 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.17 
 
 
1236 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.36 
 
 
1217 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.75 
 
 
1831 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27 
 
 
443 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.01 
 
 
1652 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  23.36 
 
 
589 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.8 
 
 
740 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.91 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  25.95 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.12 
 
 
677 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 
1247 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.48 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.51 
 
 
576 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
1190 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.72 
 
 
1443 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
696 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 
1760 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.08 
 
 
919 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.92 
 
 
1711 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  25.95 
 
 
1491 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.74 
 
 
1901 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.84 
 
 
692 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.23 
 
 
1242 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  22.65 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.28 
 
 
1188 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.79 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.7 
 
 
664 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  22.03 
 
 
578 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.25 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.45 
 
 
1357 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.39 
 
 
1474 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.66 
 
 
698 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  23.45 
 
 
1209 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  22.82 
 
 
500 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.41 
 
 
676 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.16 
 
 
1214 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.9 
 
 
742 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  25.76 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.79 
 
 
1416 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.42 
 
 
1484 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.83 
 
 
657 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.95 
 
 
1607 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 
1807 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  25.24 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 
687 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.35 
 
 
1211 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.62 
 
 
1193 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.6 
 
 
1221 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.29 
 
 
1205 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  21.5 
 
 
728 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  20.25 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 
1399 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.75 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  24.19 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 
1789 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.85 
 
 
1858 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.81 
 
 
608 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  21.92 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  23.79 
 
 
522 aa  69.7  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.27 
 
 
716 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.56 
 
 
790 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  24.35 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39442  predicted protein  23.67 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.512984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  27.48 
 
 
1100 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.91 
 
 
1661 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.16 
 
 
1766 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.95 
 
 
924 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  21.05 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  22.7 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.76 
 
 
1072 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  23.58 
 
 
1427 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  20.19 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 
577 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.68 
 
 
1626 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  23.93 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  23.93 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.81 
 
 
1262 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.35 
 
 
1686 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 
1161 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>