More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17974 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17974  predicted protein  100 
 
 
475 aa  978    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0964806  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3069  predicted protein  35.5 
 
 
409 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00421566  normal  0.0506785 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04456  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07500)  27.63 
 
 
625 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715839  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02290  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 
546 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827515  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43371  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  27.9 
 
 
533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.28 
 
 
1363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.65 
 
 
1454 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 
1163 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.13 
 
 
1557 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.82 
 
 
1236 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.96 
 
 
1523 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  32.85 
 
 
1373 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 
947 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 
1240 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 
1443 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  26.29 
 
 
728 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.28 
 
 
930 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 
1211 aa  90.1  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.91 
 
 
1652 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.75 
 
 
1411 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.33 
 
 
716 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.64 
 
 
1196 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 
1760 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 
664 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.88 
 
 
677 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.47 
 
 
682 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.42 
 
 
676 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.56 
 
 
696 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.62 
 
 
919 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 
826 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 
578 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.51 
 
 
740 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.65 
 
 
1868 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.3 
 
 
1416 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.25 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.32 
 
 
630 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.47 
 
 
1484 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.84 
 
 
692 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.35 
 
 
657 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.64 
 
 
1357 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 
1711 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.95 
 
 
1190 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.84 
 
 
1552 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 
1686 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.6 
 
 
1221 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.57 
 
 
1267 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  29.33 
 
 
774 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.35 
 
 
1598 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 
1661 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.08 
 
 
596 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.72 
 
 
1344 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.52 
 
 
675 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.95 
 
 
682 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.41 
 
 
1262 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.1 
 
 
1364 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.09 
 
 
1213 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.4 
 
 
1607 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.17 
 
 
1280 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
1878 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 
1188 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 
1247 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.15 
 
 
1831 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 
1311 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.81 
 
 
742 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.71 
 
 
1623 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.33 
 
 
589 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.54 
 
 
574 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.72 
 
 
1583 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.51 
 
 
1229 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.55 
 
 
698 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.05 
 
 
1626 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  35.77 
 
 
1275 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  22.08 
 
 
1330 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 
1474 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
687 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.44 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.64 
 
 
1398 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.84 
 
 
1188 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1714 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.15 
 
 
792 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.63 
 
 
1655 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.14 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.75 
 
 
1856 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 
954 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 
1161 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  34.29 
 
 
840 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.59 
 
 
608 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  31.07 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.05 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  25.69 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.15 
 
 
1477 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  25.2 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  26.99 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.03 
 
 
1193 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>