More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17948 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  100 
 
 
466 aa  964    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  49.76 
 
 
432 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  43.96 
 
 
435 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  45.64 
 
 
411 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  36.16 
 
 
397 aa  276  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  28.37 
 
 
429 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  27.75 
 
 
486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40760  subunit of histone acetyltransferase  27.23 
 
 
402 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500001  normal  0.43958 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  29.94 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  28.33 
 
 
492 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86817  Ribosome assembly protein  28.16 
 
 
506 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.189505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.96 
 
 
1652 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  26.05 
 
 
489 aa  94  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  27.64 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.93 
 
 
1443 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.09 
 
 
596 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  26.7 
 
 
501 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 
1188 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 
1878 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.29 
 
 
676 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.12 
 
 
1357 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 
947 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 
1411 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
577 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.4 
 
 
1196 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.56 
 
 
664 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.86 
 
 
1363 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.32 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.76 
 
 
1221 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 
696 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.05 
 
 
1193 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.58 
 
 
1711 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.22 
 
 
1474 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.5 
 
 
828 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.47 
 
 
1163 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.34 
 
 
1209 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  32.07 
 
 
1714 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05910  hypothetical protein  27.8 
 
 
949 aa  73.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 
1686 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 
1760 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 
1858 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  28.74 
 
 
1077 aa  73.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.23 
 
 
919 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  30.14 
 
 
1364 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 
687 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  23.57 
 
 
1289 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.82 
 
 
1217 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 
1789 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  25.91 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.84 
 
 
742 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  30.56 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.69 
 
 
733 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.48 
 
 
1236 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.76 
 
 
698 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 
576 aa  70.1  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.22 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 
1557 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.5 
 
 
677 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.03 
 
 
737 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1177 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  24.8 
 
 
538 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 
1552 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.91 
 
 
657 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
954 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  31.15 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.97 
 
 
790 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  31.11 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  28.25 
 
 
820 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.09 
 
 
630 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.26 
 
 
1831 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05930  snoRNA binding protein, putative  26.82 
 
 
1382 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 
1190 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.07 
 
 
682 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  24.21 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 
1661 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.4 
 
 
692 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  24.85 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
1161 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 
1599 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 
1240 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
1161 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.47 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  25.79 
 
 
379 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  28.33 
 
 
535 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  30.53 
 
 
618 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  27.1 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.55 
 
 
865 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  23.87 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.58 
 
 
757 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  25.97 
 
 
1462 aa  63.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  27.86 
 
 
609 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.06 
 
 
682 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.92 
 
 
1623 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.59 
 
 
1209 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.45 
 
 
792 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.07 
 
 
1247 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30 
 
 
1344 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 
1491 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21794  predicted protein  25.88 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>