More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17728 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  100 
 
 
509 aa  1061    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  35.65 
 
 
609 aa  246  6.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  34.4 
 
 
1093 aa  237  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.48 
 
 
1107 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  32.26 
 
 
970 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  32.24 
 
 
939 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  31.25 
 
 
956 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  32.76 
 
 
1517 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  31.21 
 
 
1222 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  31.04 
 
 
1558 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  30.94 
 
 
1431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  32.33 
 
 
1414 aa  183  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  33.25 
 
 
589 aa  183  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  30.29 
 
 
1096 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  33.79 
 
 
495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  29.35 
 
 
1259 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  29.64 
 
 
1111 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  31.15 
 
 
1901 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  31.94 
 
 
535 aa  166  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  30.09 
 
 
479 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
1155 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  28.69 
 
 
1161 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 
1090 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  29.01 
 
 
1100 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  30.16 
 
 
509 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.01 
 
 
977 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
1110 aa  157  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  30.19 
 
 
711 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.77 
 
 
1150 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  27.71 
 
 
1904 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  27.1 
 
 
1031 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  29.03 
 
 
663 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  29.51 
 
 
1088 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  29.51 
 
 
1088 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  27.79 
 
 
1443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.68 
 
 
1134 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.47 
 
 
1062 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  27.56 
 
 
959 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.47 
 
 
988 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  26.33 
 
 
1354 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
1104 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  26.99 
 
 
1386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  28.6 
 
 
1045 aa  140  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
848 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  29.66 
 
 
1193 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  25.66 
 
 
1120 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  26.67 
 
 
1112 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  25.66 
 
 
1120 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  26.33 
 
 
1362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  26.96 
 
 
1357 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
1068 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.75 
 
 
1082 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  39.67 
 
 
1698 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  27.15 
 
 
983 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  27.25 
 
 
985 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  28.61 
 
 
821 aa  133  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 
1073 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  40.13 
 
 
1557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 
1073 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  42.44 
 
 
1023 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 
1073 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 
1073 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  25.87 
 
 
1025 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  47.37 
 
 
1326 aa  130  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  26.46 
 
 
1142 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  44.74 
 
 
1053 aa  129  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  37.71 
 
 
1566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.86 
 
 
1091 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  27.94 
 
 
975 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  26.64 
 
 
1064 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  27.56 
 
 
809 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1073 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  29.66 
 
 
993 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  29.6 
 
 
1156 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.97 
 
 
950 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  38.6 
 
 
1407 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
1112 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1082 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 
1246 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  39.49 
 
 
1765 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1082 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1082 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  26.33 
 
 
1064 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  27.93 
 
 
818 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  43.67 
 
 
1070 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.67 
 
 
1178 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.38 
 
 
1113 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
1113 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  33.82 
 
 
995 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  27.44 
 
 
1164 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  40 
 
 
1034 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
876 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  40.65 
 
 
1159 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 
966 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  40 
 
 
1519 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  26.32 
 
 
1016 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
1068 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
1066 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.33 
 
 
1087 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>