More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17628 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17628  predicted protein  100 
 
 
390 aa  811    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12116  predicted protein  53.35 
 
 
406 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000866479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.38 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.34 
 
 
384 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07028  hypothetical protein similar to thymidylate synthase (Broad)  43.99 
 
 
674 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.78 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.88 
 
 
379 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.88 
 
 
379 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.78 
 
 
379 aa  249  8e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.28 
 
 
365 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.11 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.18 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.18 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  40 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.06 
 
 
367 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.34 
 
 
371 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.78 
 
 
370 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 
392 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  41.34 
 
 
371 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.93 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.21 
 
 
380 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.73 
 
 
374 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.44 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 
392 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.33 
 
 
369 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.06 
 
 
370 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  37.17 
 
 
406 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.98 
 
 
387 aa  237  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.94 
 
 
370 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.77 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.28 
 
 
385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.67 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.84 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.11 
 
 
386 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.61 
 
 
379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.23 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.73 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.23 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.22 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.2 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.8 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  38.02 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.56 
 
 
375 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
370 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.55 
 
 
377 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.12 
 
 
377 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.67 
 
 
375 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.27 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.38 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.84 
 
 
376 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.18 
 
 
385 aa  232  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.91 
 
 
380 aa  232  8.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.5 
 
 
381 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.47 
 
 
380 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.22 
 
 
372 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
397 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
472 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.27 
 
 
373 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.22 
 
 
372 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.23 
 
 
387 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.24 
 
 
355 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
372 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.75 
 
 
407 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.3 
 
 
397 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.11 
 
 
376 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.24 
 
 
376 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150936  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1289  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.46 
 
 
347 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
378 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.86 
 
 
379 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.8 
 
 
399 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.89 
 
 
367 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.78 
 
 
372 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.06 
 
 
392 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
374 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
374 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.91 
 
 
383 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
374 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
374 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1567  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.52 
 
 
390 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.94 
 
 
375 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>