More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17519 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  69.23 
 
 		 143 aa  213  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  68.57 
 
 		 142 aa  206  8e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  66.67 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  64.29 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  51.13 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  48.87 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  48.12 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  46.62 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  44.36 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  45.32 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  45.32 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  43.57 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  45.26 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  44.6 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  44.53 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  43.57 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  41.73 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  44.36 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  40 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  40.85 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  43.61 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  40.88 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  40.88 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  44.53 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  37.96 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  44.36 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  35.46 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  37.68 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  42.11 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  39.39 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  41.04 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  35 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  35.86 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  36.57 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  35.62 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  37.98 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  34.04 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  35.07 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  38.06 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  32.64 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  35.56 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  31.94 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  32.61 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  32.62 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  35.86 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  34.33 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  35.92 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  38.06 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  35.56 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  33.78 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  38.06 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  31.91 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  33.81 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  34.01 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  34.01 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  35.25 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  34.03 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  33.09 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  35.56 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  34.06 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>