27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17414 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  58.94 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  59.7 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  56.59 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  57.97 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  41.24 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  38.14 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  41.24 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  39.18 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  41.24 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  37.11 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  38.14 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  41.84 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  41.24 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  37.37 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  39 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  36 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  38 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  35.05 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  33.66 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  37.37 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  34.95 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  36.54 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  34.02 
 
 		 125 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  31.37 
 
 		 133 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  34.41 
 
 		 131 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  30.3 
 
 		 131 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>