More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17362 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17362  predicted protein  100 
 
 		 190 aa  401  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.937042  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9912  predicted protein  62.5 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.13 
 
 		 311 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07230  methionine-S-sulfoxide reductase  39.43 
 
 		 210 aa  124  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04210  protein-methionine-S-oxide reductase, putative  39.18 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0621  peptide methionine sulfoxide reductase  39.76 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  37.79 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  39.01 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.67 
 
 		 334 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87980  predicted protein  40.22 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  37.99 
 
 		 168 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  40.34 
 
 		 162 aa  118  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  39.76 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  39.76 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.2 
 
 		 290 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  40.35 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  38.1 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.87 
 
 		 338 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  37.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  37.65 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  35.75 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  35.75 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  35.26 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  38.55 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.52 
 
 		 284 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  37.28 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  35.75 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  35.5 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 216 aa  111  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  38.65 
 
 		 223 aa  111  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  35.71 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  39.64 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  40.74 
 
 		 216 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  37.28 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.72 
 
 		 333 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  37.79 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  39.52 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  39.23 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  37.43 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  35.33 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  37.28 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  36.75 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  39.18 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  38.65 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  37.85 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  38.46 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  36.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  39.76 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  36.84 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  36.75 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  39.16 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  38.6 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  37.42 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.88 
 
 		 287 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  37.65 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3367  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/MsrB  36.63 
 
 		 456 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  36.31 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  39.88 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  37.87 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 159 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  39.41 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 159 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  36.26 
 
 		 216 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  36 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  36.87 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  41.1 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  37.13 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  39.41 
 
 		 215 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  36.63 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  35.8 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  36.84 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  36.57 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  37.72 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  36.16 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  36.99 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1074  peptide methionine sulfoxide reductase  39.29 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  40.49 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  34.94 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  39.41 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  37.71 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  37.35 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.12 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  36.99 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  36.99 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  36.14 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  37.43 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  36.47 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  37.8 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  36.14 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  35.59 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  36.81 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  36.69 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  37.35 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  35.88 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.02 
 
 		 309 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06881  peptide methionine sulfoxide reductase  38.24 
 
 		 241 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.572964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  34.94 
 
 		 219 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  39.13 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>