More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16987 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_16987  predicted protein  100 
 
 
404 aa  826    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  43.42 
 
 
421 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.31 
 
 
446 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.951835  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  41.28 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.18 
 
 
417 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2407  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.98 
 
 
417 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2529  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.18 
 
 
426 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0322  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.85 
 
 
424 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2710  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.15 
 
 
428 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  36.88 
 
 
427 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1460  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
442 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  37 
 
 
416 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.24 
 
 
427 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.39 
 
 
427 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.98 
 
 
427 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.75 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.88 
 
 
441 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2495  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
427 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.72 
 
 
427 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  36.72 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.72 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.72 
 
 
455 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.72 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  36.72 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.72 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.72 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2938  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
427 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71109  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.58 
 
 
427 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404894  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
427 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.97 
 
 
462 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.48 
 
 
454 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
438 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.48 
 
 
454 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1745  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.84 
 
 
432 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  41.32 
 
 
405 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.98 
 
 
453 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.98 
 
 
453 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.98 
 
 
453 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.98 
 
 
453 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.98 
 
 
453 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0465  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.58 
 
 
407 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.06 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
433 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3401  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.68 
 
 
432 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.08 
 
 
438 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.477524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.81 
 
 
433 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  35.42 
 
 
398 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
433 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
433 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  35.5 
 
 
435 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
433 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.67 
 
 
480 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.16 
 
 
433 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.76 
 
 
436 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.57 
 
 
436 aa  222  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.61 
 
 
545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.41 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.69 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.34 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0424079 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.16 
 
 
495 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  35.22 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.15 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1885  ATP-dependent RNA helicase  34.72 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00339592  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  35.77 
 
 
507 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  35.71 
 
 
579 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.72 
 
 
433 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 
433 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 
433 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
463 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.03 
 
 
452 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.54 
 
 
433 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.52 
 
 
507 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.56 
 
 
422 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3598  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.98 
 
 
381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.41 
 
 
507 aa  215  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
525 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1136  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.04 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.19 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
526 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
525 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  33.42 
 
 
429 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.49 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4569  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.37 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  34.24 
 
 
540 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.99 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3728  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201471  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.15 
 
 
565 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1532  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  35.45 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.21 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.57 
 
 
624 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.4 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.42 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.82 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.59 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>