More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16911 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  100 
 
 
378 aa  789    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  46.54 
 
 
407 aa  344  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0855  RNA methyltransferase  43.09 
 
 
493 aa  325  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03280  tRNA methyltransferase, putative  32.68 
 
 
613 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51919  tRNA(m5U54)methyltransferase  33.18 
 
 
560 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00837808  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00141  tRNA methyltransferase (Eurofung)  32.42 
 
 
575 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6437  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.86 
 
 
455 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.01 
 
 
436 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  33.51 
 
 
405 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  30.94 
 
 
419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.44 
 
 
460 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  28.4 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  33.24 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50774  RNA methyltransferase tRNA(m5U54)methyltransferase  31.19 
 
 
542 aa  179  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.2179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  28.71 
 
 
454 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.43 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  27.73 
 
 
454 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  28.24 
 
 
446 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  29.04 
 
 
457 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  33 
 
 
428 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.03 
 
 
440 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  27.53 
 
 
458 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.17 
 
 
460 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.52 
 
 
457 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27.7 
 
 
419 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.95 
 
 
485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  30.58 
 
 
439 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  29.65 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  30.31 
 
 
438 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  26.76 
 
 
460 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.37 
 
 
443 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  27.75 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  31 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.84 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.4 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3098  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.34 
 
 
431 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000185167  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3277  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.58 
 
 
431 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  normal  0.0635589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  29.83 
 
 
440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3163  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.34 
 
 
431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0558904  normal  0.0471726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  29.8 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  26.59 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  27.88 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  27.53 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3179  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.58 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0330224  normal  0.448815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  27.06 
 
 
458 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  27.8 
 
 
462 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  32.48 
 
 
397 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  26.82 
 
 
458 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.79 
 
 
449 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  29 
 
 
446 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  29.83 
 
 
433 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  29.83 
 
 
433 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.6 
 
 
443 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 
437 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  26.82 
 
 
458 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  27.19 
 
 
455 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3116  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.92 
 
 
431 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0559824  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  28.21 
 
 
461 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  28.21 
 
 
461 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3237  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.57 
 
 
431 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0193521  normal  0.0341148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2194  RNA methyltransferase  29.1 
 
 
407 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  26.82 
 
 
454 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  26.6 
 
 
439 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  29.27 
 
 
456 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.28 
 
 
477 aa  159  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  28.95 
 
 
488 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  29.09 
 
 
438 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  25.64 
 
 
448 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  27.29 
 
 
454 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.78 
 
 
455 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  26.59 
 
 
458 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.98 
 
 
465 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  26.59 
 
 
458 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.04 
 
 
455 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2923  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164007  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.86 
 
 
441 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  26.85 
 
 
459 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.77 
 
 
455 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.34 
 
 
433 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.25 
 
 
444 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4045  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.34 
 
 
433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000364507  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  26.98 
 
 
459 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  26.45 
 
 
459 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  26.45 
 
 
459 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0947  (Uracil-5)-methyltransferase  29.14 
 
 
393 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.45 
 
 
459 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.45 
 
 
459 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  29.44 
 
 
455 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  26.34 
 
 
452 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.64 
 
 
449 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  26.4 
 
 
459 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03529  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.33 
 
 
439 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  26.4 
 
 
459 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  29.21 
 
 
414 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  31.86 
 
 
430 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>