More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16859 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  45.52 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  45.66 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  45.17 
 
 		 326 aa  220  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  40.78 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  40.38 
 
 		 2081 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  41.76 
 
 		 391 aa  202  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.326026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  36.33 
 
 		 489 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  39.35 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  34.54 
 
 		 596 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  37.79 
 
 		 303 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45850  silent information regulator protein Sir2  36.61 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  36.73 
 
 		 219 aa  132  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  34.82 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  33.67 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  38.92 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  36.02 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  36.02 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  35.12 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  33.93 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.72 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  33.06 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  32.33 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  31.22 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  31.06 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  34.69 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  31.06 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  29.96 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  31.25 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  31.53 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  29.2 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  33.49 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  34.35 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  30.8 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  31.76 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  30.8 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  32.41 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  30.36 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.07 
 
 		 231 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  33.02 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  30.2 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  30.81 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  31.72 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  33.66 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  32.29 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  30.6 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  32.99 
 
 		 241 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  29.73 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  34.43 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  33.63 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  27.63 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  34.43 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  29.96 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  31.03 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  31.58 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.13 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  31.94 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  28.18 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  33.78 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49645  NAD-dependent deacetylase HST3 (Homologous to SIR2 protein 3)  29.46 
 
 		 342 aa  92  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838214  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  32.86 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  31.65 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  31.28 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  29.31 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  30.24 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03250  hst3 protein, putative  35.15 
 
 		 389 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  32.32 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  29.31 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  32.32 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  31.6 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  30.8 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  33.17 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.75 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  27.91 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  30.05 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  31.08 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  33.03 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  31.07 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  30.45 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  32.51 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  30.21 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  26.98 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  29.09 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  28.07 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.28 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  30.41 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  30.45 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  31.4 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  29.95 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.37 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  28.51 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  30.52 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  28.77 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  27.47 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>