281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16854 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  100 
 
 
105 aa  218  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  57.58 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  48.81 
 
 
86 aa  89  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_56497  predicted protein  40.95 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  47.06 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  40.45 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  37.93 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  40.48 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  40.48 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  40.91 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  35.63 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  38.37 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  38.82 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  35.63 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  41.86 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  41.86 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  40.7 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  39.08 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  40.7 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  42.35 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  36.9 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  39.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  39.29 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  33.33 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.9 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  41.18 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  37.65 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  37.65 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  37.65 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  37.65 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05410  conserved hypothetical protein  38.37 
 
 
382 aa  61.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152877  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  34.78 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  39.08 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  39.08 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  38.37 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  35.71 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  29.63 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  39.53 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  30.38 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.12 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  38.82 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  34.12 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  40 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  42.17 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  39.08 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  40 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  39.08 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  39.08 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  39.02 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  38.82 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  40.96 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.21 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  38.55 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  38.2 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  38.1 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  35.63 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  34.88 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  36.26 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  34.09 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  34.44 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  36.05 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  33.72 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  34.48 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  37.21 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  34.88 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  34.15 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  35.23 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30564  predicted protein  37.78 
 
 
205 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  32.94 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  29.55 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  30.23 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  37.21 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  29.55 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  32.94 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  39.76 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  32.14 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  35.71 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  34.52 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>