83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16814 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16814  predicted protein  100 
 
 
662 aa  1387    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.728956  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04640  rRNA processing-related protein, putative  40.18 
 
 
830 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32792  predicted protein  39.65 
 
 
768 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.980986  normal  0.0911162 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01367  Ribosome biogenesis protein erb1 (Eukaryotic ribosome biogenesis protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDL3]  38.68 
 
 
799 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000573535  normal  0.686963 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119515  Ribosome biogenesis protein BOP1 (Block of proliferation 1 protein), probable  27.19 
 
 
577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.2 
 
 
1188 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 
947 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.82 
 
 
1454 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.6 
 
 
1652 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.87 
 
 
696 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.2 
 
 
1831 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  20.7 
 
 
1163 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.9 
 
 
1523 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  21.71 
 
 
1364 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.93 
 
 
1196 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.95 
 
 
1188 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  20.22 
 
 
1247 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24 
 
 
675 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.24 
 
 
1760 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 
344 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.76 
 
 
930 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.08 
 
 
1357 aa  54.3  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  24.36 
 
 
914 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.15 
 
 
1236 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.98 
 
 
1686 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20 
 
 
1363 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  18.18 
 
 
682 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  22.81 
 
 
1878 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 
1193 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  20 
 
 
1213 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.12 
 
 
1474 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  21.81 
 
 
1221 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.08 
 
 
1661 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 
1807 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  19.78 
 
 
677 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  42.86 
 
 
342 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  21.09 
 
 
774 aa  48.9  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  21.5 
 
 
317 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  22.62 
 
 
1204 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 
344 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  21.15 
 
 
316 aa  47.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  30.14 
 
 
778 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  35.71 
 
 
335 aa  47.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.2 
 
 
576 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.81 
 
 
1190 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 
1209 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 
826 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  25 
 
 
962 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  42 
 
 
589 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  21.05 
 
 
1330 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  21.13 
 
 
1242 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  45.71 
 
 
578 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.01 
 
 
1267 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.18 
 
 
630 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  21.55 
 
 
1901 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.14 
 
 
636 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  41.86 
 
 
334 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  26.54 
 
 
1205 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  20.06 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.35 
 
 
1481 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  19.76 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.48 
 
 
733 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  35.14 
 
 
316 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  19.51 
 
 
439 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  56.25 
 
 
1214 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  36.11 
 
 
316 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.94 
 
 
608 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1161 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1161 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39442  predicted protein  42.19 
 
 
376 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.512984  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  19.93 
 
 
316 aa  45.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  36.84 
 
 
782 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  40.32 
 
 
443 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  30.26 
 
 
1373 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  45.24 
 
 
464 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.15 
 
 
596 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  52.63 
 
 
1041 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 
1858 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.13 
 
 
792 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  22.67 
 
 
1270 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 
1190 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.6 
 
 
1711 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  35.85 
 
 
756 aa  43.9  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>