More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16803 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16803  predicted protein  100 
 
 
428 aa  877    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06996  ubiquinone biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04590)  34.16 
 
 
685 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0373045  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52708  predicted protein  36.31 
 
 
647 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04150  mitochondrion protein, putative  31.53 
 
 
1149 aa  219  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43325  predicted protein  29.43 
 
 
532 aa  176  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456138  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50081  predicted protein  27.66 
 
 
569 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50296  predicted protein  30.56 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.42 
 
 
544 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36156  predicted protein  28.57 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.838478  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.38 
 
 
525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.38 
 
 
525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14688  predicted protein  26.39 
 
 
402 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.07 
 
 
544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  27.36 
 
 
544 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.71 
 
 
514 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.89 
 
 
544 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.96 
 
 
506 aa  136  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.36 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.41 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.06 
 
 
549 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.71 
 
 
543 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.77 
 
 
522 aa  133  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.2 
 
 
525 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.46 
 
 
545 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.3 
 
 
543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.3 
 
 
543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.37 
 
 
525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.3 
 
 
543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.78 
 
 
558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.84 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  26.82 
 
 
560 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.53 
 
 
546 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1599  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.95 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  28.03 
 
 
588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.47 
 
 
543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.59 
 
 
537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.3 
 
 
549 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.05 
 
 
527 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.25 
 
 
521 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.25 
 
 
521 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.2 
 
 
525 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.73 
 
 
553 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.2 
 
 
525 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.61 
 
 
521 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.71 
 
 
546 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.47 
 
 
546 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.25 
 
 
525 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  126  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.61 
 
 
521 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.06 
 
 
549 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.78 
 
 
504 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  27.01 
 
 
541 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.23 
 
 
546 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.17 
 
 
546 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  26.35 
 
 
549 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.17 
 
 
546 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  26.29 
 
 
560 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.2 
 
 
521 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.17 
 
 
546 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.25 
 
 
525 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.17 
 
 
546 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.17 
 
 
546 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2194  hypothetical protein  27.59 
 
 
441 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0378977  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.61 
 
 
521 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.96 
 
 
525 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  23.1 
 
 
558 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.96 
 
 
525 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.96 
 
 
525 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.61 
 
 
522 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.06 
 
 
549 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.81 
 
 
525 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26 
 
 
551 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.96 
 
 
525 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.2 
 
 
525 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.78 
 
 
541 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.88 
 
 
546 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.77 
 
 
525 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  26.12 
 
 
549 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.36 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  24.29 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.36 
 
 
549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.53 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  24.82 
 
 
534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>