284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16766 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  36.91 
 
 
245 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  37.58 
 
 
242 aa  88.2  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  35.29 
 
 
245 aa  87  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  35.57 
 
 
246 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  35.57 
 
 
246 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  36.88 
 
 
246 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  35.21 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  36.17 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  35.62 
 
 
245 aa  82  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  35.66 
 
 
245 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  35.14 
 
 
343 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  30 
 
 
241 aa  70.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  33.1 
 
 
274 aa  70.5  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  29.93 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  34.35 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  33.1 
 
 
501 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  32.43 
 
 
265 aa  63.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  33.57 
 
 
260 aa  62.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.47 
 
 
693 aa  59.3  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04940  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
308 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.189992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  32.12 
 
 
238 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.79 
 
 
693 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.46 
 
 
699 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.23 
 
 
736 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57180  exosome exoribonuclease  25.14 
 
 
289 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.659196  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.79 
 
 
701 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  33.8 
 
 
238 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.23 
 
 
701 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.54 
 
 
700 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.53 
 
 
700 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.03 
 
 
747 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  34.23 
 
 
741 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.52 
 
 
705 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.97 
 
 
752 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.46 
 
 
708 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.33 
 
 
735 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.46 
 
 
708 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.1 
 
 
699 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.13 
 
 
698 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.13 
 
 
698 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
262 aa  51.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32 
 
 
692 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4265  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.82 
 
 
715 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32 
 
 
690 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0143  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.93 
 
 
703 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  31.88 
 
 
235 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.87 
 
 
707 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  30.82 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.33 
 
 
712 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  31.65 
 
 
248 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2817  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.34 
 
 
757 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1024  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
715 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.547998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  31.85 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2415  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.32 
 
 
730 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.556673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.21 
 
 
697 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
712 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  31.91 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  28.67 
 
 
240 aa  48.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  30.57 
 
 
252 aa  48.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1430  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.2 
 
 
703 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0599  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.86 
 
 
736 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0742  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1294  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0739218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1285  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  31.43 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  30.34 
 
 
239 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  30.94 
 
 
279 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
713 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00845594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3218  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.14 
 
 
716 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634558  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3604  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.33 
 
 
725 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0558589  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32 
 
 
703 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  28.66 
 
 
711 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2440  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.77 
 
 
716 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225847  normal  0.0323804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  29.8 
 
 
761 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.86 
 
 
701 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.45 
 
 
718 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.52 
 
 
717 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30 
 
 
702 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  29.45 
 
 
246 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
712 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
712 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
712 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
712 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
712 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0783  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32 
 
 
701 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491346  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0868  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.28 
 
 
727 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
712 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.8 
 
 
722 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0071  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.78 
 
 
714 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000128899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  30.5 
 
 
241 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1641  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.77 
 
 
715 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0365038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.85 
 
 
710 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.28 
 
 
753 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.77 
 
 
714 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.33 
 
 
723 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>