281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16693 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  54.69 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  43.81 
 
 		 254 aa  169  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  43.56 
 
 		 326 aa  167  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  44.74 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  48.99 
 
 		 309 aa  162  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  45.79 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  47.42 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  47.15 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  45.55 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  43.52 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  43.65 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  44.56 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  41.88 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  43.22 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  42.35 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  42.56 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  42.56 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  43.01 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  43.15 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  42.56 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  43.15 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  43.52 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  41.54 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  41.62 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  41.03 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  40.51 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  43.59 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  42.13 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  42.71 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  43.81 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  42.71 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  43.09 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  42.35 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  43.88 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  42.78 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  41.84 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  42.35 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  41.33 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  42.11 
 
 		 190 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  41.24 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  44.62 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  42.02 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  43.39 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.56 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  43.68 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  40.91 
 
 		 191 aa  134  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  40.1 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.38 
 
 		 190 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  40.51 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  42.05 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.38 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  35.9 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.38 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.22 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  33.16 
 
 		 305 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  34.44 
 
 		 299 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.93 
 
 		 299 aa  92.8  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 		 74 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.57 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  28.12 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  48 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 		 76 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  46.67 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.66 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 		 73 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  41.89 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  41.03 
 
 		 103 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.98 
 
 		 80 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.67 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  42.31 
 
 		 76 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  42.65 
 
 		 74 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  46.67 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  42.65 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.12 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  45.9 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.9 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  44.26 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  45.59 
 
 		 80 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>