76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16674 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16674  predicted protein  100 
 
 
376 aa  786    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87597  predicted protein  32.16 
 
 
371 aa  152  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0227  type II DNA modification methyltransferase, putative  27.6 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0255  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.09 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.111291 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16070  predicted protein  28.09 
 
 
398 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171714  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  31.38 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  24.31 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.78 
 
 
727 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.78 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
460 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
490 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
460 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.05 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
456 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  23.28 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
456 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  22.19 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
427 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  22.86 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  22.46 
 
 
328 aa  53.5  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  21.32 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.47 
 
 
329 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.33 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.75 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  22.45 
 
 
371 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  22.15 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  21.18 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  20.68 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.22 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
434 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  25.4 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  24.08 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4397  modification methylase ScrFIB  28.45 
 
 
324 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  24.61 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  22.78 
 
 
489 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  22.66 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  25.41 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.21 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  25.54 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.23 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  21.17 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  22.29 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  21.07 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.81 
 
 
431 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.24 
 
 
338 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  22.1 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.46 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  21.95 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  20.34 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.56 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.56 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  20.97 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  25.49 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  22.05 
 
 
657 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  22.53 
 
 
327 aa  43.9  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  20.31 
 
 
438 aa  43.5  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  22.62 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  22.04 
 
 
406 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
318 aa  42.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>