64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16649 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  100 
 
 		 461 aa  945    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  44.56 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  41.14 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  42.61 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  40.36 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.44 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.27 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.72 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.44 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.03 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.01 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  26.47 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.17 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.94 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.92 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.72 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.49 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.84 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.36 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  27.53 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.06 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  27.1 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.42 
 
 		 388 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.42 
 
 		 388 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.88 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  23.45 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  26.47 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33278  predicted protein  97.44 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.64 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  25.06 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  25.66 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.86 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  23.38 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  25.63 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  23.08 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  23.08 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  23.08 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  22.82 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  22.86 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  25.77 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  21.76 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  21.36 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.47 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  21.56 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  23.09 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  25.35 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  21.41 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  21.41 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  21.41 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  23.64 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  21.75 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  21.36 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  22.89 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  21.36 
 
 		 349 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  22.38 
 
 		 350 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  21.24 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  21.23 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.93 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  22.09 
 
 		 350 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  21.13 
 
 		 349 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  32.89 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  22.55 
 
 		 349 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>