255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16633 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  100 
 
 
81 aa  163  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  46.75 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  46.75 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  50 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  43.04 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  42.68 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  39.02 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  43.59 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  44.16 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  47.44 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  47.37 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40.54 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  39.47 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  42.86 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  45.33 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  43.24 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  37.66 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  44.74 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  48.44 
 
 
277 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  45.33 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  40.51 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  46.05 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  44.16 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  41.1 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  48.05 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  42.86 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  37.5 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  42.11 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.25 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  40.51 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  33.77 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  37.5 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  43.24 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  40.51 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  41.56 
 
 
373 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
181 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  38.96 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  37.97 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  38.89 
 
 
552 aa  57.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  41.03 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  37.66 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  40.26 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  35.14 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  33.77 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.77 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  41.56 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  36.99 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  39.19 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  39.19 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  45.33 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  38.67 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  45.33 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>