21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16560 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  30.97 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  24.63 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  29.63 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  25.38 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.14 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.46 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  26.72 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  27.14 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  26.77 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  25.37 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  25.99 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  23.93 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  25.29 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  26.07 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.87 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  25.55 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.31 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_55141  ribosomal RNA processing protein  22.71 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  20.85 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  28.73 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>