More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16391 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  72.95 
 
 		 648 aa  834    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  100 
 
 		 590 aa  1202    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.25 
 
 		 676 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  55.12 
 
 		 817 aa  608  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.74 
 
 		 685 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  52.4 
 
 		 883 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.74 
 
 		 696 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  58.94 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  58.15 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.58 
 
 		 673 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  63.89 
 
 		 476 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  51.74 
 
 		 787 aa  572  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  50.53 
 
 		 867 aa  573  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.26 
 
 		 697 aa  558  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  50.55 
 
 		 673 aa  515  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  48.37 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 		 652 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 		 697 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.82 
 
 		 641 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 		 647 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.15 
 
 		 694 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 		 639 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.19 
 
 		 638 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  53.6 
 
 		 699 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  51.9 
 
 		 682 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  49.12 
 
 		 646 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  51.3 
 
 		 706 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  50.89 
 
 		 641 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.43 
 
 		 616 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 		 640 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 		 639 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.43 
 
 		 616 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50.7 
 
 		 639 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 		 699 aa  475  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 		 686 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 		 714 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.39 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.39 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.48 
 
 		 610 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 		 642 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 		 637 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  50.1 
 
 		 694 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.3 
 
 		 638 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.02 
 
 		 679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  53.02 
 
 		 616 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.3 
 
 		 639 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.5 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.2 
 
 		 649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.04 
 
 		 717 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.04 
 
 		 713 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50 
 
 		 639 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 		 634 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 613 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  48.81 
 
 		 627 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.8 
 
 		 621 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  49.5 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  46.54 
 
 		 645 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 631 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 		 629 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  48.74 
 
 		 613 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 		 645 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.9 
 
 		 631 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  49.3 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 		 630 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.26 
 
 		 655 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  49.81 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 631 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.81 
 
 		 657 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.44 
 
 		 617 aa  462  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  49.2 
 
 		 628 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  51.7 
 
 		 615 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.8 
 
 		 621 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  48.24 
 
 		 659 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 		 635 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  51.92 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.31 
 
 		 641 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 616 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 		 629 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.9 
 
 		 628 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.7 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 		 630 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.52 
 
 		 620 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  51.7 
 
 		 627 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  50.1 
 
 		 654 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 		 663 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>